Estabilización molecular del comportamiento de los lipoplejos aniónicos mediante las fuerzas de martini

Resumen

El presente trabajo  buscó estudiar y estabilizar de manera molecular el comportamiento del lipoplejo aniónico, la simulación molecular de este sistema se la realizó con grano grueso de Martini, el sistema tuvo sus parámetros iniciales, el mismo que se cambiaron y nos permitieron observar su comportamiento. La variación de los parámetros dio lugar a 3 sistemas aparte del inicial lo que permitió el estudio y comparación de los resultados. Se determinó los parámetros que permitieron que el sistema pueda ser más estable. La construcción del sistema fue mediante una caja de 120x120x200 Ángstroms el cual contiene al cilindro formado por el ADN y el lípido 1,2- dioleoilsn-glicero-3-fosfo-L-serina de sodio (DOPS) están expuestos en un modelo primitivo 1:1. La constante dieléctrica del sistema fue de 15, presión 1 bar y su temperatura de 303 K, debido a que el ADN, el lípido (DOPS) y los iones de sal están cargados surgen fenómenos de correlación de carga y correlación de tamaño, es decir, interaccionan entre sí por efecto de sus cargas. Para la configuración inicial se requirió que se solvate, minimice y equilibre su energía por lo que se intercambió las variables en los diferentes sistemas. El primero fue el sistema inicial con la bicapa, el lípido y el ADN, con concentraciones de -sol W: 90, -sol WF: 10, -sold: 0.47, cargas de BICAPA: -450, ADN: -4, DOPS: -, en otro se le añadió NaCl, con concentraciones añadidas de -salt: 0.15, cargas agregadas de Na: +1, Cl: -1, H: +1, O: -2, mientras que otro la carecía Na: 0, Cl: 0, con valores de distancia de 0, 15 y 3.5 nm respectivamente. El número de configuraciones dependió en gran parte de los resultados obtenidos frente a los cambios de la formación del sistema, valores del tamaño de la caja, distancia, concentración y carga. La agregación de iones al sistema hizo que llegado a un cierto punto este se estabilice y para contrarrestar las interacciones electrostáticas se empleó el formalismo de las sumas de Ewald. Se puede concluir de manera general que la concentración de sal en el sistema 2 fue de gran ayuda para que llegue a un determinado punto y se estabilice. Esto debido al modelo de la doble capa eléctrica porque la densidad de carga superficial aumentó y se produjo la inversión de cargas o sobrecarga del sistema. De esta manera los cationes y aniones cambiaron su comportamiento, haciendo que estos sean atraídos y dando origen a las interacciones electrostáticas tomando un valor de energía de interacción total de 5.62030e+05 kJ/mol en tu tiempo de 1040.577 s.