Retos en la implementacin de equipos automatizados de cultivos bacteriolgicos

Challenges in the implementation of automated bacteriological culture equipment

Desafios na implementao de equipamentos automatizados de cultura bacteriolgica

Damaris Beln Mosquera Bajaa I
mosquera-damaris1605@unesum.edu.ec 
https://orcid.org/0009-0000-0356-7430
  
,Luisa Nikolle Pinargote Paredes II
pinargote-luisa1874@unesum.edu.ec https://orcid.org/0009-0001-0666-6730
 
,Vargas Reyes Yarisel Elizabeth III
merchan-yadira8513@unesum.edu.ec 
https://orcid.org/0000-0003-2555-6905 
,Jos Clmaco Caarte Vlez IV
jose.canarte@unesum.edu.ec
https://orcid.org/0000-0002-5611-8492

 

 

 

 

 

 

 

 

 


Correspondencia: mosquera-damaris1605@unesum.edu.ec

Ciencias de la Salud

Artculo de Investigacin

 

* Recibido: 26 de junio de 2025 *Aceptado: 24 de julio de 2025 * Publicado: 27 de agosto de 2025

 

       I.          Estudiante Investigadora de la carrera de Laboratorio Clnico UNESUM Jipijapa, Ecuador.

     II.          Estudiante Investigadora de la carrera de Laboratorio Clnico UNESUM Jipijapa, Ecuador.

   III.          Estudiante Investigadora de la carrera de Laboratorio Clnico UNESUM Jipijapa, Ecuador.

  IV.          Docente de la carrera de Laboratorio Clnico UNESUM Jipijapa, Ecuador.

 


Resumen

Si bien los equipos automatizados de cultivo microbiolgico ofrecen mayor estandarizacin, reproducibilidad y potencial eficiencia en el flujo de trabajo, su adopcin se ve obstaculizada por la complejidad de las muestras, los altos costos, las dificultados de integracin, limitaciones de personal, obstculos regulatorios y desafos operativos. El objetivo del estudio fue analizar los retos en la adopcin de equipos automatizados para cultivos. Se utiliz una metodologa de estudio documental con un enfoque explicativo y de revisin bibliogrfica. Recopilando informacin de artculos publicados en revistas indexadas en bases de datos como; Scopus, Biomed Central, Scielo y Science Direct. Los resultados revelaron que el desafo ms comnmente mencionado es la diversidad y la complejidad de las muestras. La adaptacin del flujo de trabajo complejo surge como otro desafo, ya que se requieren modificaciones sustanciales en los procesos bien establecidos; La automatizacin ciertamente ha demostrado mejorar la precisin del diagnstico en todos los contextos. Adems, el alto rendimiento se logra a travs de mecanismos complementarios; Los sistemas principales identificados son la WASP de Copan, APAS Independence y BD Kiestra ReadA. Adems, Clever Culture ha sido identificado en varios estudios. Se concluy que la implementacin de sistemas automatizados para cultivos bacteriolgicos enfrenta desafos multifactoriales que abarcan aspectos tcnicos, regulatorios y operativos; La automatizacin en cultivos bacteriolgicos demuestra un impacto positivo consistente en la precisin diagnstica; El panorama actual de sistemas automatizados para cultivos bacteriolgicos muestra una oferta tecnolgica diversificada.

Palabras clave: bacterias, automatizacin, cultivos, laboratorio.

Abstract

While automated microbiological culture equipment offers greater standardization, reproducibility, and potential workflow efficiency, its adoption is hampered by sample complexity, high costs, integration difficulties, personnel limitations, regulatory hurdles, and operational challenges. The objective of this study was to analyze the challenges faced by the adoption of automated culture equipment. A documentary study methodology was used with an explanatory and bibliographic review approach. Information was compiled from articles published in journals indexed in databases such as Scopus, Biomed Central, Scielo, and Science Direct. The results revealed that the most commonly cited challenge is sample diversity and complexity. Adapting complex workflows emerges as another challenge, requiring substantial modifications to well-established processes; automation has certainly been shown to improve diagnostic accuracy across all settings. Furthermore, high throughput is achieved through complementary mechanisms; the primary systems identified are Copan's WASP, APAS Independence, and BD Kiestra ReadA. Clever Culture has also been identified in several studies. It was concluded that the implementation of automated systems for bacteriological cultures faces multifactorial challenges encompassing technical, regulatory, and operational aspects; automation in bacteriological cultures demonstrates a consistent positive impact on diagnostic accuracy; the current landscape of automated systems for bacteriological cultures showcases a diverse technological offering.

Keywords: bacteria, automation, cultures, laboratory.

Resumo

Embora o equipamento automatizado de cultura microbiolgica oferea maior padronizao, reprodutibilidade e potencial eficincia do fluxo de trabalho, sua adoo dificultada pela complexidade da amostra, altos custos, dificuldades de integrao, restries de pessoal, obstculos regulatrios e desafios operacionais. O objetivo do estudo foi analisar os desafios na adoo de equipamentos automatizados para lavouras. Utilizou-se uma metodologia de estudo documental com abordagem explicativa e reviso bibliogrfica. Coleta de informaes de artigos publicados em peridicos indexados em bases de dados como; Scopus, Biomed Central, Scielo e Science Direct. Os resultados revelaram que o desafio mais citado a diversidade e complexidade das amostras. A adaptao do fluxo de trabalho complexo surge como outro desafio, pois so necessrias modificaes substanciais em processos bem estabelecidos; A automao certamente provou melhorar a preciso do diagnstico em todos os contextos. Alm disso, o alto desempenho alcanado por meio de mecanismos complementares; Os principais sistemas identificados so o WASP da Copan, o APAS Independence e o BD Kiestra ReadA. Alm disso, a Clever Culture foi identificada em vrios estudos. Concluiu-se que a implementao de sistemas automatizados para culturas bacteriolgicas enfrenta desafios multifatoriais que abrangem aspectos tcnicos, regulatrios e operacionais; A automao em culturas bacteriolgicas demonstra um impacto positivo consistente na preciso diagnstica; O cenrio atual de sistemas automatizados para culturas bacteriolgicas mostra uma oferta tecnolgica diversificada.

Palavras-chave: bactrias, automao, culturas, laboratrio.

Introduccin

Durante las ltimas dcadas, se ha exigido a los laboratorios clnicos que hagan ms con menos, y la microbiologa diagnstica no ha sido la excepcin. Se nos exige detectar con precisin microorganismos resistentes a los antibiticos, realizar pruebas de deteccin de infecciones hospitalarias en pacientes, proporcionar resultados cada vez ms rpidos para asegurar una menor estancia hospitalaria. La automatizacin en microbiologa clnica es cada vez ms comn y, segn se informa, ofrece varias ventajas sobre el laboratorio manual. La mayora de los estudios han reportado tiempos de respuesta rpidos para los resultados de los cultivos, incluyendo los tiempos de identificacin de patgenos y sus respectivas susceptibilidades antimicrobianas(1).

La bacteriologa clnica siempre ha sido una actividad muy manual y laboriosa. A diferencia de otras disciplinas, como la qumica clnica, la biologa molecular, la inmunologa y la hematologa, la automatizacin total en bacteriologa clnica no es tarea fcil. La eficiencia de un sistema automatizado en bacteriologa clnica depende en gran medida de su capacidad para procesar muestras clnicas altamente heterogneas, debido a la variedad de contenedores y a la complejidad de los procedimientos analticos. Los primeros sistemas automatizados independientes en bacteriologa clnica se lanzaron en la dcada de 1970. Fueron diseados para detectar el crecimiento bacteriano en muestras de hemocultivo utilizando cultivos basados ​​en caldo (2).

Los cultivos bacterianos siguen siendo esenciales para estudios experimentales y mecanicistas detallados en la investigacin del microbioma, y ​​los mtodos tradicionales para aislar bacterias individuales de ecosistemas microbianos complejos requieren mucha mano de obra, son difciles de escalar y carecen de integracin fenotipo-genotipo. los microbios necesitan ser aislados y cultivados para diseccionar mecansticamente sus roles funcionales en el hbitat y la mirada de procesos interespecies que ocurren. Los mtodos de cultivo tradicionales que dependen de la seleccin aleatoria de colonias por "fuerza bruta" son tediosos y requieren mucha mano de obra(3).

El mercado de pruebas automatizadas para cultivos se valor en unos 4630 millones de dlares en 2024 y se espera que casi se duplique a aproximadamente 9160 millones de dlares para 2030, con una tasa de crecimiento anual compuesta de aproximadamente 10,23 % durante el perodo 2025-2030. El crecimiento del mercado es impulsado por la necesidad de detectar infecciones del torrente sanguneo, como la sepsis, lo ms pronto posible. Al mismo tiempo, el envejecimiento de la poblacin mundial y la creciente incidencia de enfermedades crnicas que aumentan el riesgo de infeccin. Se espera que el mercado de la recoleccin automatizada de sangre sea de otros USD 1290 millones en 2024 y de USD 1520 millones para 2025, con una TCCA del 18,2 %. Se espera que el mercado alcance los 2940 millones de dlares en 2029(4).

En Sudamrica, Brasil lidera la regin con aproximadamente el 35% de participacin de mercado debido a su slida infraestructura de salud, apoyo del gobierno y la creciente demanda de diagnsticos microbianos rpidos. Se valor en aproximadamente 417,5 millones de dlares en 2024 y se espera que alcance los 726 millones de dlares para 2033, con una tasa compuesta de crecimiento anual del 6,34%. Cabe destacar que Latinoamrica est presenciando la adopcin de sistemas de vanguardia como WASPLab de Copan, pionero en la automatizacin digital de la microbiologa. El crecimiento del mercado de la regin est impulsado por la necesidad de mejorar la eficiencia del diagnstico, cumplir con las normas internacionales y abordar la alta carga de enfermedades infecciosas y crnicas(5).

La automatizacin en los laboratorios de microbiologa es crucial para mejorar los tiempos de diagnstico y tratamiento, especialmente en pacientes crticos, los sistemas automatizados permiten una reduccin significativa en el tiempo para obtener resultados. Estos han aportado avances importantes en la identificacin rpida y precisa de bacterias, levaduras y otros microorganismos, as como en la evaluacin de su sensibilidad antimicrobianos. El propsito del estudio fue analizar los retos en la adopcin de equipos automatizados para cultivos.

Materiales y mtodos

Diseo y tipo de estudio

La presente investigacin se desarroll como un estudio documental con un enfoque explicativo y de revisin bibliogrfica.

Estrategia de bsqueda

Se realiz una bsqueda exhaustiva de literatura cientfica en espaol y portugus, recopilando informacin de artculos publicados en revistas indexadas en bases de datos como; Scopus, Biomed Central, Scielo y Science Direct. La seleccin de los datos se efectu mediante el uso de palabras clave como "laboratory", "standardization", "microbiological" y "culture equipment", combinadas con operadores booleanos "and" y "or". El objetivo fue identificar publicaciones relacionadas con la relacin entre la seguridad y la calidad en un laboratorio clnico y posteriormente identificar estrategias para su mejora.

Criterios de inclusin y exclusin

Criterios de inclusin: Se incluyeron artculos en espaol y portugus publicados entre 2019 y 2024. Para su seleccin, se analizaron los apartados de materiales y mtodos de cada investigacin, priorizando aquellos con diseos acordes a los objetivos del estudio. Adems, se consideraron publicaciones que proporcionaban definiciones claras y conclusiones consistentes con los resultados presentados.

Criterios de exclusin: Quedaron fuera de la revisin los artculos que no cumplan con los criterios mnimos de informacin, aquellos publicados antes de 2020 y los que no disponan de acceso gratuito.

Materiales, equipos e instrumentos

Entre los recursos empleados para llevar a cabo la investigacin se incluyeron hojas, bolgrafos, conexin a internet y una computadora porttil.

Consideraciones ticas

En cumplimiento de la legislacin vigente (Ley 23 de 1983), se garantiz el respeto a los derechos de autor mediante la adecuada citacin y referencia de las fuentes, siguiendo los lineamientos de la normativa Vancouver.

 

 

 

 

 

 

 

 

Resultados

Tabla 1. Principales retos que dificultan la implementacin de sistemas automatizados para cultivo.

Autor/ Ref

Pas/Ao

Metodologa

Resultados

Kenny y col.(6)

Irlanda, 2021

Descriptivo

Diversidad y complejidad de las muestras

Khalid y col.(7)

Pakistn, 2021

Cualitativo

Adaptacin del flujo de trabajo complejo

Escobedo y col.(8)

Mxico, 2021

Estudio de casos

Deben validarse para cumplir con los estndares de acreditacin y reglamentarios

Chisholm y col.(9)

Algeria, 2021

Descriptivo

Estrictos protocolos de asepsia un error puede provocar una contaminacin generalizada

Shwetmala y col.(10)

India, 2021

Descriptivo

Flexibilidad limitada

Diversidad de muestras analizadas

Jain y col.(11)

Vietnam, 2022

Descriptivo

Dificultad para distinguir colonias

Diversidad de muestras

Gupta y col.(12)

India, 2023

Descriptivo

Los diferentes microorganismos tienen requisitos de crecimiento especifico

Mazumder y col.(13)

Bangladesh, 2023

Transversal

Los sistemas automatizados suelen estar optimizados para procedimientos estandarizados

Yang y col.(14)

China, 2024

Descriptivo

Mantenimiento, calibracin y control de calidad regulares

Alighardashi y col.(15)

Irn, 2024

Descriptivo

Falta de estandarizacin

Limitaciones del software

Amaike y col.(16)

Nigeria, 2025

Transversal

Trazabilidad y auditabilidad total de las muestras

Anlisis e interpretacin: Los resultados mostraron que el desafo ms comnmente mencionado es la diversidad y la complejidad de las muestras. La adaptacin del flujo de trabajo complejo surge como otro desafo, ya que se requieren modificaciones sustanciales en los procesos bien establecidos. Los aspectos regulatorios son otra barrera importante; los sistemas deben validarse rigurosamente para cumplir con los criterios de acreditacin. La flexibilidad restringida de los equipos automatizados es un contraste con la variabilidad inherente de las muestras clnicas. Se vuelve crtico mantener protocolos de asepsia estrictos, ya que cualquier error puede desencadenar contaminacin generalizada.

Tabla 2. Impacto de la automatizacin en la mejora de la precisin diagnstica

Autor/ Ref

Pas/Ao

Metodologa

Resultados

van Altena y col.(17)

Holanda, 2021

Cualitativo

Instrumentos de alta precisin y deteccin superior

Khavandi y col.(18)

Reino Unido, 2023

Descriptivo

Reduccin del error humano

Protocolos consistentes, eliminando la variabilidad en el manejo

Jabbour y col.(19)

Estados Unidos, 2023

Descriptivo

Reproductibilidad mejorada

Al-Antari y col.(20)

Corea del Sur, 2023

Cualitativo

Tiempo de respuesta ms rpido

Alto rendimiento

Khavandi y col.(21)

Reino Unido, 2023

Cualitativo

Mejora en la precisin de pruebas, lectura de placa digital

Rahman y col.(22)

Estados Unidos, 2024

Cualitativo

Automatizacin mejorada en la deteccin, clasificacin de bacterias

Zuhair y col.(23)

Pakistn, 2024

Descriptivo

Reduccin del error humano

Sensibilidad y especificidad

Kusunose y col.(24)

Japn, 2024

Descriptivo

Minimizacin del manejo manual

Gala y col.(25)

Holanda, 2024

Cualitativo

Mayor sensibilidad y especificidad

Maleki y col.(26)

Estados Unidos, 2024

Descriptivo

Cultivo automatizado y lectura digital de placas

Takita y col.(27)

Japn, 2025

Descriptivo

Instrumentos de alta precisin y deteccin

Anlisis e interpretacin: La automatizacin ciertamente ha demostrado mejorar la precisin del diagnstico en todos los contextos. Adems, el alto rendimiento se logra a travs de mecanismos complementarios. La principal causa de todo el sistema es la eliminacin de los errores humanos, es decir, la variabilidad debida al manejo manual. Los instrumentos extremadamente precisos y las capacidades tcnicas superiores son un mecanismo por derecho propio; la reproductibilidad mejorada es garanta de un alto rendimiento.

 

 

Tabla 3. Sistemas automatizados para cultivos bacteriolgicos

Autor/ Ref

Pas/Ao

Metodologa

Resultados

Altheide, T.(28)

Canad, 2020

Descriptivo

Clever Culture Systems APAS Independence automated culture

Goneau y col.(29)

Canad, 2020

Cualitativo

COPAN Walk-Away Specimen Processor (WASP)

Brenton y col.(30)

Australia, 2020

Descriptivo

APAS Independence for automated reading and preliminary interpretation of urine cultures

Berneking y col.(31)

Alemania, 2020

Cualitativo

The BD Phoenix CPO detect (PCD)

Gao y col.(32)

China, 2021

Cualitativo

Copan Walk Away Specimen Processor (WASP)

Gammel y col.(33)

Estados Unidos, 2021

Cualitativo

(Clever Culture System, Bch, Switzerland)

Cherkaoui y col.(34)

Suiza, 2022

Descriptivo

Automated EUCAST RAST (rapid antimicrobial susceptibility test)

Dwivedi y col.(35)

Estados Unidos, 2022

Descriptivo

Assessment system (APAS independence) and artificial intelligence (AI)

Burns y col.(36)

Estados Unidos, 2023

Descriptivo

Clever Culture System, Bch, Switzerland

Jacot y col.(37)

Francia, 2024

Descriptivo

BD Kiestra ReadA

Cintrn y col.(38)

Estados Unidos, 2025

Descriptivo

WASP (Walk Away Specimen Processor)

Anlisis e interpretacin: Se identific una considerable diversidad de plataformas automatizadas disponibles. Los sistemas principales identificados son la WASP de Copan, APAS Independence y BD Kiestra ReadA. Adems, Clever Culture ha sido identificado en varios estudios, y BD Phoenix CPO detect es una alternativa adicional. De hecho, la distribucin geogrfica de los estudios presenta la predominancia de los pases desarrollados. Estados Unidos lidera la lista con 4 publicaciones, seguido de Canad con 2 estudios.

 

Discusin

Los hallazgos identificados en esta revisin revelan mltiples desafos significativos en la adopcin de sistemas automatizados para cultivos bacteriolgicos. Los retos ms frecuentemente reportados incluyen la diversidad y complejidad de las muestras clnicas, las limitaciones en la flexibilidad de los sistemas, y la necesidad de validacin rigurosa para cumplir con estndares de acreditacin. La investigacin de Zimmermann, S.(39) en un estudio multicntrico realizado en hospitales asiticos confirm que la heterogeneidad de muestras clnicas representa el 68% de las dificultades tcnicas en la implementacin de sistemas automatizados, corroborando los hallazgos de diversidad de muestras reportados por mltiples autores en nuestra revisin.

Contrariamente a nuestros resultados, el estudio prospectivo de Antonios y col.(40) en laboratorios norteamericanos sugiere que los desafos de estandarizacin pueden ser superados mediante protocolos de implementacin gradual, reportando una tasa de xito del 89% en la adopcin de sistemas automatizados cuando se aplican estrategias de implementacin estructuradas.

Los resultados demuestran consistentemente que la automatizacin mejora significativamente la precisin diagnstica a travs de mltiples mecanismos. Los beneficios ms reportados incluyen la reduccin del error humano, el aumento de la sensibilidad y especificidad, y la mejora en la reproductibilidad de los resultados. La investigacin longitudinal de Schoffelen y col.(41) en laboratorios europeos demostr una reduccin del 73% en errores diagnsticos y un aumento del 41% en la concordancia inter-laboratorio tras la implementacin de sistemas automatizados, validando los beneficios de precisin reportados en nuestra revisin.

Sin embargo, el metaanlisis de Plebani y col.(42) cuestiona la superioridad universal de los sistemas automatizados, reportando que en el 23% de los casos estudiados, los mtodos manuales realizados por tcnicos experimentados mostraron precisin comparable o superior, especialmente en la identificacin de microorganismos raros.

La revisin identifica una diversidad notable de sistemas automatizados disponibles, destacando plataformas como WASP de Copan, APAS Independence, y BD Kiestra ReadA como las ms frecuentemente estudiadas. Los sistemas muestran capacidades especficas que van desde el procesamiento automatizado de muestras hasta la lectura digital de placas con inteligencia artificial. La predominancia de estudios en pases desarrollados (Estados Unidos, Canad, Australia) sugiere una adopcin desigual a nivel global. El estudio de Xie y col.(43) evalu cinco de los sistemas identificados en nuestra revisin (WASP, APAS, BD Phoenix, BD Kiestra, y Clever Culture System) en condiciones estandarizadas, confirmando su efectividad relativa y estableciendo perfiles de rendimiento especficos para cada plataforma.

Contrario a la tendencia observada, el anlisis econmico de Toro y col.(44) sugiere que varios de los sistemas identificados como "exitosos" en nuestra revisin presentan limitaciones significativas de costo-efectividad en entornos de recursos limitados, con solo el 34% de las implementaciones mostrando retorno de inversin positivo en el primer ao.

Es necesario realizar investigaciones especficas sobre la viabilidad y adaptacin de sistemas automatizados en entornos con recursos limitados, considerando factores econmicos, de infraestructura y capacitacin tcnica. Se requieren estudios prospectivos que evalen el impacto econmico real de la automatizacin durante perodos de 5-10 aos.

Conclusiones

       La implementacin de sistemas automatizados para cultivos bacteriolgicos enfrenta desafos multifactoriales que abarcan aspectos tcnicos, regulatorios y operativos. La diversidad y complejidad inherente de las muestras clnicas constituye la principal barrera, requiriendo que los sistemas posean flexibilidad suficiente para manejar la heterogeneidad de especmenes. Los aspectos regulatorios y de validacin representan obstculos significativos que demandan inversin considerable en tiempo y recursos para cumplir con estndares de acreditacin.

       La automatizacin en cultivos bacteriolgicos demuestra un impacto positivo consistente en la precisin diagnstica, estableciendo ventajas claras sobre los mtodos manuales tradicionales. La reduccin significativa del error humano, combinada con la implementacin de protocolos estandarizados, mejora sustancialmente la reproductibilidad y confiabilidad de los resultados.

       El panorama actual de sistemas automatizados para cultivos bacteriolgicos muestra una oferta tecnolgica diversificada, dominada por plataformas como WASP de Copan, APAS Independence y BD Kiestra ReadA. La concentracin de estudios en pases desarrollados refleja una adopcin desigual de estas tecnologas a nivel global, sugiriendo barreras de acceso relacionadas con recursos econmicos e infraestructura.

 

 

Referencias bibliogrficas

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