La aparición de quistes en el ganado bovino son las principales alteraciones reproductivas que afecta a la fertilidad y al rendimiento del animal dentro de un sistema de producción, la aparición de quistes en el ganado bovino tiene dos orígenes. Los quistes foliculares se caracterizan por ocasionar infertilidad o celos prolongados en las vacas. Su formación empieza cuando un folículo en etapa dominante no se rompe es decir no permite la liberación del óvulo de manera normal, dando como consecuencia la acumulación de líquido amarillento y semiviscoso.

Los quistes Luteales aparecen a partir de una luteinización incompleta es decir generan una estructura idéntica al cuerpo lúteo que produce progesterona y se encuentra conformado por tejido lúteo y áreas compactas mayores a 3 mm, el quiste luteal  pueden llegar alcanzar un diámetro de 25 mm y persiste aproximadamente 10 días en el ovario afectado, esto ocasiona un desequilibrio total en su ciclo reproductivo es decir va a existir diestros prolongados, bajas ovulaciones y en el peor de los casos infertilidad.

El diagnóstico de los quistes en bovinos se realiza mediante la palpación y la utilización de un ecógrafo, su tratamiento incluye la aplicación de hormonas como la GnRH y prostaglandinas que van a actuar para la inducción de la ovulación y la luteinización del quiste.

Los quistes de la granulosa y endometriales son las principales patologías que afecta al sistema reproductivo en las yeguas y si no son controlados a tiempo ocasionan daños irreparables e infertilidad. Los quistes de la granulosa se originan a partir de células especializadas de la granulosa en el interior del ovario y ocasiona desequilibrios hormonales que afectan a la yegua, pueden existir formaciones unilaterales o bilaterales y los principales signos que se evidencia son anestros prolongados, ninfomanía e incluso comportamientos agresivos.

Mientras tanto los quistes endometriales se localizan principalmente en el útero y se encuentran ligados a procesos degenerativos al nivel del endometrio, los quistes endometriales no son malignos en las yeguas pero su presencia interfiere en su ciclo estral y en la implantación del embrión, el diagnóstico de ambos quistes se realiza mediante la ecografía y su tratamiento varía dependiendo la utilización del fármaco hasta incluso intervenciones quirúrgicas.