Técnicas de biología molecular en el diagnóstico de enfermedades infecciosas
Molecular biology techniques in the diagnosis of infectious diseases
F As técnicas de biologia molecular no diagnóstico de doenças infecciosas
Correspondencia: carlos.marcillo@unesum.edu.ec
Ciencias de la Salud
Artículo de Investigación
* Recibido: 20 de julio de 2024 *Aceptado: 21 de agosto de 2024 * Publicado: 30 de septiembre de 2024
I. Universidad Estatal del Sur de Manabí, Docente Carrera Laboratorio Clínico, Ecuador.
II. Universidad Estatal del Sur de Manabí, Estudiante Investigador de la Carrera de Laboratorio Clínico, Jipijapa, Ecuador.
III. Universidad Estatal del Sur de Manabí, Estudiante Investigador de la Carrera de Laboratorio Clínico, Jipijapa, Ecuador.
IV. Universidad Estatal del Sur de Manabí, Estudiante Investigador de la Carrera de Laboratorio Clínico, Jipijapa, Ecuador.
Resumen
Las técnicas de biología molecular han transformado significativamente el diagnóstico de enfermedades infecciosas al ofrecer una mayor precisión, rapidez y sensibilidad en la identificación de patógenos. Este estudio analiza los métodos modernos, como la PCR, la secuenciación genética y otros enfoques moleculares utilizados en el diagnóstico de enfermedades infecciosas. Se resalta que estas técnicas facilitan la detección temprana y precisa de patógenos, incluso en casos en los que fallan los métodos tradicionales. Los hallazgos muestran que la biología molecular no solo mejora la precisión en el diagnóstico, sino que también refuerza las estrategias de tratamiento. En países como Ecuador, la implementación de estas técnicas ha demostrado ser crucial para una vigilancia efectiva y el control de enfermedades infecciosas, lo cual contribuye a mejorar los resultados clínicos y de salud pública.
Palabras clave: Biología Molecular; Diagnóstico Infeccioso; PCR; Secuenciación Genética.
Abstract
Molecular biology techniques have significantly transformed the diagnosis of infectious diseases by offering greater accuracy, speed, and sensitivity in identifying pathogens. This study analyzes modern methods such as PCR, genetic sequencing, and other molecular approaches used in the diagnosis of infectious diseases. It is highlighted that these techniques facilitate early and accurate detection of pathogens, even in cases where traditional methods fail. The findings show that molecular biology not only improves diagnostic accuracy but also reinforces treatment strategies. In countries such as Ecuador, the implementation of these techniques has proven to be crucial for effective surveillance and control of infectious diseases, which contributes to improved clinical and public health outcomes.
Keywords: Molecular Biology; Infectious Diagnosis; PCR; Genetic Sequencing.
Resumo
As técnicas de biologia molecular transformaram significativamente o diagnóstico de doenças infeciosas, oferecendo maior precisão, rapidez e sensibilidade na identificação de agentes patogénicos. Este estudo revê métodos modernos como a PCR, a sequenciação genética e outras abordagens moleculares utilizadas no diagnóstico de doenças infeciosas. De salientar que estas técnicas facilitam a deteção precoce e precisa de agentes patogénicos, mesmo nos casos em que os métodos tradicionais falham. As descobertas mostram que a biologia molecular não só melhora a precisão do diagnóstico, como também fortalece as estratégias de tratamento. Em países como o Equador, a implementação destas técnicas revelou-se crucial para uma vigilância e controlo eficazes das doenças infeciosas, o que contribui para melhorar os resultados clínicos e de saúde pública.
Palavras-chave: Biologia Molecular; Diagnóstico Infeccioso; PCR; Sequenciação Genética.
Introducción
La mejora de la especificidad, sensibilidad y rapidez de las técnicas de diagnóstico tradicionales ha sido crucial para combatir las enfermedades infecciosas. Sin embargo, gracias al progreso de la investigación y la creciente necesidad de diagnósticos precisos y efectivos, han surgido métodos de laboratorio basados en la biología molecular que se utilizan en programas de prevención, control y tratamiento. La biología molecular abrió horizontes a nuevas generaciones de científicos al estudiar los procesos e interacciones de los seres vivos a nivel molecular, creando pruebas específicas para el estudio de cada uno. La especificidad, sensibilidad, reproductibilidad y rapidez son características distintivas de las pruebas moleculares (Corvalán , Aguayo , Lévican , & Corvalán , 2020).
A nivel mundial, la biología molecular ha revolucionado el diagnóstico de enfermedades infecciosas. La PCR en tiempo real y la Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) han simplificado el diagnóstico y el seguimiento de la progresión de las enfermedades. Las técnicas mencionadas anteriormente han sido cruciales para controlar brotes como el del SARS-CoV-2, ya que permiten un seguimiento efectivo de las variantes del virus. Un estudio a nivel mundial reciente ha revelado cómo la secuenciación de ácidos nucleicos mejora la detección y el tratamiento temprano de infecciones virales y bacterianas (2).
En las últimas décadas, la biología molecular ha revolucionado el diagnóstico de enfermedades infecciosas. Estas técnicas permiten establecer un diagnóstico precoz y confiable, así como monitorear la evolución de la enfermedad y mejorar los resultados del tratamiento. Algunas de las principales técnicas de biología molecular utilizadas incluyen: Reacción en cadena de la polimerasa (PCR), PCR en tiempo real o PCR cuantitativa, Transcripción reversa PCR (RT-PCR), Microarreglos, Secuenciación de ácidos nucleicos (3).
El estudio de las técnicas de biología molecular aplicadas al diagnóstico de laboratorio de diversas enfermedades es crucial por varias razones: proporciona un conocimiento previo esencial para realizar diagnósticos efectivos; permite identificar cuál es la prueba diagnóstica más óptima y confiable; y subraya la importancia de utilizar métodos más comunes para garantizar una intervención y tratamiento adecuados. Estas técnicas moleculares son empleadas para detectar microorganismos no cultivables, identificar variantes genéticas y reconocer genes de resistencia a antibióticos o antivirales, así como otros (4).
Actualmente, en Latinoamérica se han creado técnicas moleculares rápidas que permiten detectar agentes microscópicos en un lapso de 24 a 72 horas. Durante los primeros cinco meses de 2020, la Organización Panamericana de la Salud (OPS) registró más de 1,6 millones de casos de dengues en las Américas. Brasil registró la mayor cantidad de casos, con 1.040.481, lo que representa el 65% del total, seguida por Paraguay, con 218.798, Bolivia, con 82.460, Colombia, con 54.192 y Argentina, con 79.775 casos. Las infecciones tropicales como la malaria, el dengue y la leptospirosis presentan signos y síntomas inespecíficos y requieren diagnóstico mediante pruebas serológicas y moleculares (5).
Estas técnicas permiten detectar y cuantificar incluso pequeñas cantidades de material genético de los patógenos, lo que las hace más sensibles y específicas que los métodos tradicionales de cultivo y observación microscópica. En Ecuador, también se han implementado estas técnicas de biología molecular para el diagnóstico de enfermedades infecciosas. Se utilizó PCR en tiempo real para el diagnóstico rápido de tuberculosis. Mediante el empleo de estos métodos moleculares avanzados, los investigadores pudieron realizar una vigilancia efectiva de las cepas virales presentes en la población, lo que contribuyó a una mejor comprensión de la dinámica de transmisión y la implementación de medidas de control oportunas (6). Estudios como este demuestran cómo las técnicas de biología molecular se están aplicando cada vez más en el país para mejorar el diagnóstico y seguimiento de diversas enfermedades infecciosas, tanto a nivel local como regional.
En Quito, se realizó un estudio que evaluó el uso de técnicas de secuenciación genómica para vigilar las infecciones por SARS-CoV-2, lo que permitió monitorear la difusión de diversas variantes del virus en la ciudad. Este estudio utilizó técnicas de secuenciación de ácidos nucleicos para identificar y caracterizar genéticamente las cepas de SARS-CoV-2 que se encontraron en Quito durante la pandemia de COVID-19. Gracias a estas técnicas de biología molecular sofisticadas, los investigadores pudieron monitorear mejor las variantes virales en la población (7).
Gracias a los avances en técnicas basadas en la biología molecular, el diagnóstico de enfermedades infecciosas ha experimentado un cambio significativo en los últimos años. Estas técnicas permiten un diagnóstico más temprano y confiable al tiempo que facilitan la monitorización de la enfermedad, la determinación del pronóstico y el aumento de la supervivencia (8). Las técnicas de biología molecular ofrecen una variedad de métodos para amplificar, detectar y secuenciar ácidos nucleicos (ADN o ARN, según la sospecha clínica). La automatización, la nanotecnología y la informática han mejorado el diagnóstico de enfermedades infecciosas, lo que ha permitido un tratamiento más rápido y menos costoso.
(9).
Por consiguiente, se planteó la siguiente interrogante: ¿Cuáles son las técnicas de diagnóstico de enfermedades infecciosas?
Metodología
Tipo de investigación
Esta investigación es una revisión sistemática que tiene como objetivo sintetizar la evidencia actual sobre cómo las técnicas de biología molecular ayudan a diagnosticar enfermedades infecciosas.
Fuentes de información
Para la recopilación de datos, se utilizaron los siguientes buscadores científicos: PubMed, Google Académico, Dialnet, Semantic Scholar. Se incluyeron estudios publicados en los últimos 5 años para asegurar la relevancia y actualidad de los datos.
Estrategias de búsqueda
La búsqueda se realizó utilizando palaras clave y términos MeSH relacionados con las técnicas de biología molecular y el diagnóstico de enfermedades infecciosas. Los términos específicos utilizados incluyeron: “PCR en diagnóstico de enfermedades infecciosas”, “PCR tuberculosis”, “PCR malaria”, “PCR VIH”, “RT- PCR en diagnóstico de infección virales”, “Microarrays en diagnósticos de infecciones”, “técnicas para diagnóstico molecular”,
Criterios de Inclusión
Estudios publicados en inglés y español. Artículos de investigación original. Se analizaron los materiales y métodos de cada artículo, cuyo diseño cumpliera con los criterios definidos. Revisiones sistemáticas. Estudios que incluyan datos relevantes sobres las técnicas de biología molecular y su aplicación en el diagnóstico de enfermedades infecciosas. Estudios realizados en Humanos. Publicaciones con datos cuantitativos y cualitativos, sobre el impacto de estas técnicas de biología molecular para mejorar el diagnóstico y la salud.
Criterios de Exclusión
Estudios con una antigüedad mayor a 5 años. Publicaciones que no proporcionen datos claros o específicos, sobre la aplicación de este tipo de técnica en el diagnóstico de enfermedades infecciosas. Artículos duplicados o trabajos que no permitieron su acceso libre.
Evaluación de la Calidad de los Estudios
Para la evaluación de la calidad y sesgo de los estudios incluidos se utilizó la herramienta de evaluación de la calidad “Cochrane”. Los criterios evaluados incluyeron: calidad metodológica, tamaño de muestra, población estudiada, validez y confiabilidad de las mediciones utilizadas, trasparencia en representación de resultados y conclusiones.
Consideraciones Éticas
Se respetaron los derechos y la privacidad de los autores de los estudios incluidos. Además, se aseguró la transparencia en la selección, evaluación y síntesis de los datos, sin conflictos de interés.
Desarrollo
Biología molecular
La biología molecular estudia los métodos fundamentales a nivel molecular en los seres vivos, incluyendo la replicación, transcripción y traducción del material genético. Se centra en los ácidos nucleicos como el ADN, que contiene la información hereditaria, y el ARN, que participa en la síntesis de proteínas. La replicación del ADN es un proceso semiconservativo catalizado por la enzima ADN polimerasa (10). La transcripción copia la información genética del ADN en ARN mensajero mediante la ARN polimerasa, y la traducción utiliza esta información para dirigir la síntesis de proteínas en los ribosomas. La regulación génica controla la expresión de genes a nivel transcripcional y postranscripcional, utilizando mecanismos como factores de transcripción, modificaciones epigenéticas y ARN no codificante. Estos principios son esenciales para entender los procesos moleculares que sustentan la vida (11).
Tipos de técnicas de biología molecular
En las últimas décadas, este tipo de métodos ha revolucionado el diagnóstico de enfermedades infecciosas. Algunas de las técnicas más populares utilizadas son:
Reacción en cadena de la polimerasa (PCR)
Es una técnica que permite amplificar y detectar secuencias específicas de ácido desoxirribonucleico (ADN) o ácido ribonucleico (ARN) de manera rápida, sensible y específica. Esta técnica genera millones de copias de una secuencia de ADN a partir de una pequeña cantidad de material genético inicial, y es ampliamente utilizada para detectar patógenos como virus, bacterias y parásitos en muestras clínicas. Además, la PCR permite identificar mutaciones o variantes genéticas, lo que es útil para el diagnóstico de enfermedades genéticas o infecciosas, y tiene aplicaciones en diversos campos como la genética, microbiología, virología, oncología y medicina forense (Delgado & Suárez, 2019).
PCR en tiempo real o PCR cuantitativa (qPCR)
Esta es una técnica avanzada de biología molecular que permite amplificar y cuantificar simultáneamente secuencias específicas de ácidos nucleicos (ADN o ARN) en muestras biológicas. A diferencia de la PCR convencional, la qPCR monitorea la amplificación en cada ciclo, detectando el producto de PCR a medida que se genera mediante el uso de sondas o agentes intercalantes que emiten fluorescencia al unirse al ADN amplificado. Esta técnica permite determinar la cantidad inicial de una secuencia diana en una muestra, ya sea de forma absoluta o relativa, y se utiliza ampliamente en el diagnóstico de enfermedades infecciosas, detección de patógenos, cuantificación de expresión génica, y detección de transgenes, entre otras aplicaciones. En resumen, la qPCR combina la amplificación específica de secuencias de ácidos nucleicos con la cuantificación en tiempo real, proporcionando resultados rápidos, sensibles y precisos en diversas aplicaciones biomédicas y de investigación (13).
Transcripción inversa PCR (RT-PCR)
La transcripción inversa PCR (RT-PCR) es una técnica de biología molecular que convierte secuencias específicas de ARN en ADN complementario (cDNA) mediante la acción de la enzima transcriptasa inversa, para luego amplificar estas secuencias de cDNA utilizando la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) convencional. Esta técnica es fundamental para la detección y cuantificación de virus y otros patógenos que no poseen un ciclo de replicación de ADN, y es ampliamente utilizada en el diagnóstico de enfermedades infecciosas, detección de patógenos y cuantificación de la expresión génica. La RT-PCR integra la conversión de ARN a ADN con la amplificación de secuencias de ADN específicas, ofreciendo resultados rápidos, sensibles y precisos en múltiples aplicaciones biomédicas y de investigación (14).
Microarreglos
Los microarreglos son una técnica de biología molecular que permite analizar la expresión génica a nivel celular midiendo la cantidad de ARNm (ácido ribonucleico mensajero) bajo distintas condiciones. Esta técnica identifica qué genes están activos y su nivel de expresión, permitiendo comparar la expresión génica entre diferentes estados, como entre células sanas y enfermas, o distintos tejidos. Ampliamente utilizados en la biomédica, los microarreglos ayudan a comprender cómo se expresan los genes en enfermedades específicas, como el cáncer o las enfermedades infecciosas, proporcionando una valiosa herramienta para estudiar la expresión génica en diversos contextos biológicos y entender mejor el desarrollo de enfermedades (15).
Secuenciación de ácidos nucleicos
La secuenciación de ácidos nucleicos es una técnica clave en biología molecular que permite determinar la secuencia exacta de los nucleótidos (adenina, guanina, citosina y timina/uracilo) en moléculas de ADN o ARN. En la secuenciación de ADN, se identifica la secuencia genética de los organismos, se detectan mutaciones y variantes, y se exploran la estructura y función de los genes mediante métodos como la secuenciación de Sanger y las tecnologías de secuenciación de nueva generación (NGS). Por otro lado, la secuenciación de ARN se utiliza para analizar el transcriptoma, estudiar la expresión génica, identificar isoformas de ARN y detectar variantes de splicing alternativo, utilizando técnicas como RNA-seq y scRNA-seq (16). Las aplicaciones de la secuenciación de ácidos nucleicos abarcan desde el diagnóstico y detección de enfermedades genéticas e infecciosas hasta la identificación de variantes genéticas asociadas a enfermedades, estudios de evolución y filogenia, análisis de la diversidad microbiana en muestras ambientales, y la investigación de la estructura. y función de genes y genomas. En resumen, la secuenciación de ácidos nucleicos es una herramienta indispensable en biología molecular y genómica, proporcionando información detallada sobre la composición y estructura del ADN y ARN, con numerosas aplicaciones tanto en la investigación como en el diagnóstico (17).
Diagnóstico de Enfermedades Infecciosas
El proceso de determinar la causa específica de una infección en un paciente se conoce como diagnóstico de enfermedades infecciosas. Este proceso requiere una mezcla de evaluaciones clínicas, pruebas de laboratorio y, ocasionalmente, estudios de imágenes. Esta se defino como la determinación de la causa específica de una infección en un paciente, a través de la evaluación de los signos y síntomas, el historial médico, pruebas de laboratorio y otras técnicas diagnósticas. El objetivo principal es identificar el agente infeccioso (bacteria, virus, hongo, parásito, etc.) responsable de la enfermedad del paciente, para poder aplicar el tratamiento más apropiado (18).
Causa
Glorio, R & Carbia, S en el año 2023 del país de Argentina nos indican que, las enfermedades infecciosas son causadas por agentes patógenos como bacterias, virus, hongos o parásitos, mientras que otras enfermedades pueden tener causas genéticas, metabólicas, autoinmunes o relacionadas con el estilo de vida. Las enfermedades infecciosas pueden transmitirse de persona a persona, de animal a persona o a través de vectores, a diferencia de otras enfermedades que no son contagiosas y no se transmiten entre individuos (19).
Síntomas
Chew, C; Kirmani, N & Liang, S en el año 2020 del país Estados Unidos nos dicen que, las enfermedades infecciosas a menudo presentan síntomas como fiebre, escalofríos, fatiga y malestar general, con variaciones según el agente infeccioso. Otras enfermedades pueden tener síntomas más específicos según el sistema afectado. El diagnóstico de enfermedades infecciosas se basa en pruebas de laboratorio para identificar el agente causal, mientras que otras enfermedades se diagnostican mediante exámenes físicos, pruebas de laboratorio, estudios de imagen y evaluación de historial médico (20).
Tratamiento
Las enfermedades infecciosas se tratan con antibióticos, antivirales, antifúngicos o antiparasitarios según el agente causal, en contraste con otras enfermedades que se tratan con medicamentos específicos para la condición, terapia, cambios en el estilo de vida o cirugía (21).
Ventajas de las técnicas de biología molecular
Como lo indican Sánchez, L., & Fuentes, D. (22) las técnicas de biología molecular ofrecen varias ventajas en el diagnóstico de enfermedades:
Rapidez y precisión: Permiten identificar patógenos y secuencias genómicas mutadas de manera rápida y precisa, en comparación con las pruebas convencionales.
Alta sensibilidad: Tienen una alta sensibilidad tanto en la identificación de patógenos como de secuencias genómicas mutadas.
Detección temprana y precisa: Facilitan una detección temprana y precisa de enfermedades, lo que permite un tratamiento oportuno y adecuado.
Información valiosa: sobre la enfermedad: proporcionan información importante sobre la naturaleza de la enfermedad, lo que mejora el tratamiento y los resultados para los pacientes.
Identificación del agente etiológico: Permiten la identificación del agente etiológico de manera rápida y sin riesgo de contaminación.
Diagnóstico de neuro infecciones: En el caso de las neuro infecciones, las técnicas de biología molecular modificaron el tratamiento antimicrobiano empírico en un 34,2% de los casos en pacientes sin infección por VIH ni antecedentes neuroquirúrgicos, y en un 42,9% de los casos en pacientes con infección por VIH.
Limitaciones de las técnicas de biología molecular
Si bien las técnicas de biología molecular presentan numerosas ventajas, también tienen algunas limitaciones:
Costo: Aunque los costos han disminuido considerablemente con el desarrollo de metodologías de alto rendimiento como la secuenciación de nueva generación (NGS), aún pueden ser una limitación en algunos contextos.
Necesidad de expertos: Requieren personal altamente capacitado y laboratorios especializados para su aplicación.
Enfoque limitado: Algunas técnicas se enfocan únicamente en el análisis de material genético (ADN y ARN), dejando de lado otros aspectos que pueden influir en el diagnóstico de la enfermedad.
Posibles resultados falsos negativos: Aunque tienen una alta sensibilidad, en algunos casos pueden arrojar resultados falsos negativos, especialmente cuando la carga viral o bacteriana es baja.
Tabla 1: Diagnóstico molecular de enfermedades.
Autores |
Año |
País |
Metodología |
Prueba utilizada |
Hallazgos |
Referencia |
Moreno , Herrera , & Satizabal |
2019 |
Colombia |
Estudio descriptivo, transversal |
Panel Setene AllplexTM Parasite Assay. |
Un total de 87 parásitos fueron identificados y un 27% (n=74) de las muestras resultaron positivas por diagnóstico molecular. |
(23) |
Sánchez, García, González , & Mira |
2019 |
Perú |
Estudio de cohorte |
PCR dúplex en tiempo real (qPCR) y PCR en forma de gel anidada lista para usar (LeishGelPCR). |
Se mostró una sensibilidad del 98% en ambos enfoques. La especificidad fue del 100% para LeishGelPCR y del 98% para Leish-qPCR. Los límites de detección de ambos protocolos fueron similares (0,5 y 0,2 parásitos/reacción) |
(Sánchez, García, González , & Mira, 2019) |
Ávila , et al. |
2020 |
Uruguay |
Estudio caso-control |
PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR) |
Se logró mediante la qPCR una infección por Plasmodium falciparum en muestras microscópicamente negativas que no fueron detectadas por los kits comerciales. |
(25) |
Taborda, et al. |
2020 |
México |
Revisión bibliográfica |
Antimicrobial Resistance Direct Flow Chip®(AMR) |
Después de analizar 90 hisopos nasales en paralelo para encontrar S. aureus resistente a la meticilina (SARM), el método tradicional encontró 8 muestras positivas y 82 negativas, mientras que el kit AMR encontró 10 muestras positivas (gen mecA positivo) y 80 negativas, con 2 falsos positivos. Las muestras clínicas tenían una sensibilidad del 100 % y una especificidad del 97 %, respectivamente.Después de analizar 90 hisopos nasales en paralelo para encontrar S. aureus resistente a la meticilina (SARM), el método tradicional encontró 8 muestras positivas y 82 negativas, mientras que el kit AMR encontró 10 muestras positivas (gen mecA positivo) y 80 negativas, con 2 falsos positivos. La sensibilidad y la especificidad de las muestras clínicas fueron del 100 y 97 respectivamente. |
(26) |
Vigil, Sánchez, & Alonso |
2021 |
Ecuador |
Estudio descriptivo, transversal |
La detección molecular se realizó utilizando el panel gastrointestinal FilmArray (FilmArray GI).® |
Se encontraron 409 virus, 386 bacterias y 19 parásitos utilizando el panel FilmArray GI®. El rotavirus fue el virus más común y uno de los más comunes en ambos grupos de edad. |
(27) |
Dabanch |
2021 |
Brasil |
Estudio de cohorte |
GeneXpert® MTB/RIF |
Entre la población coinfectada por el VIH, el uso de GeneXpert aumentó significativamente la detección de casos de tuberculosis, con una sensibilidad que oscila entre el 68% y el 100%, superando la microscopía de frotis de esputo. |
(28) |
Acosta, Meneses, Arévalo, Altamirano, & Gonzáles |
2022 |
España |
Estudio caso-control |
RT-PCR- Xpert Xpress SARS-CoV2 |
Trece evaluaciones de cuatro pruebas moleculares diferentes detectaron correctamente un promedio del 95% de las muestras con infección por COVID‐19. Alrededor del 1% de las muestras dieron resultados falsos positivos. |
(29) |
Pin, Cerón, Rezabala, & Pinta |
2023 |
Colombia |
Revisión bibliográfica |
PCR Amplificación del gen B1 |
En 2/15 casos, la PCR fue positiva en LCR y en 7/7 casos, la PCR fue positiva en BAL. 12 de cada 24 casos recibieron una prueba de sangre, y 9 de ellos resultaron positivos. Estos resultados demuestran el valor clínico del uso de la técnica de PCR para el diagnóstico de toxoplasmosis cerebral, y es aún más importante para identificar otras formas clínicas que normalmente no se diagnostican. |
(30) |
Mohammed |
2023 |
Venezuela |
Estudio descriptivo, transversal |
Análisis de mutación en genes BRCA1 y BRCA2 |
Se encontraron 107 pacientes portadores de mutaciones deletéreas en este grupo de pacientes, 69 (64,5%) localizados en BRCA1, y 38 (35,5%) en BRCA2. |
(31) |
Pomeda & Alfonsel |
2023 |
Perú |
Estudio de cohorte |
PCR en tiempo real |
Se detectaron cepas de tuberculosis en el 15% de las muestras analizadas, con una alta especificidad. |
(32) |
Leyva & de la torre |
2023 |
Paraguay |
Estudio caso-control |
Ensayo de amplificación mediada por transcripción |
La técnica mostró una sensibilidad del 98%, detectando todas las muestras positivas confirmadas. |
(33) |
Centeno |
2023 |
Panamá |
Revisión bibliográfica |
Secuenciación de próxima generación |
Se identificaron variantes del virus en el 35% de las muestras, permitiendo un mejor entendimiento de la resistencia a los antivirales. |
(34) |
Pacheco |
2024 |
Ecuador |
Estudio descriptivo, transversal |
Electroforesis y cromatografía |
Las pruebas genéticas moleculares desempeñan un papel importante en la identificación de individuos portadores de rasgos de talasemia que pueden causar resultados adversos en la descendencia. Además, las pruebas genéticas prenatales pueden identificar fetos con fenotipos de globina graves. |
(35) |
Análisis e interpretación
Los estudios sobre técnicas de biología molecular en el diagnóstico de enfermedades infecciosas destacan la precisión de métodos como la PCR, la secuenciación de próxima generación y la electroforesis para detectar patógenos y mutaciones genéticas con alta sensibilidad. Estas técnicas no solo mejoran la precisión diagnóstica, sino que también permiten identificar cepas y variantes no detectables por métodos convencionales. Su implementación optimiza enfoques terapéuticos y estrategias de prevención, y mejora los resultados clínicos.
Tabla 2: Identificación de Patógenos usando Técnicas de Biología Molecular
Año |
País |
Metodología |
Método Utilizado |
Hallazgos |
Referencia |
|
Chávez & Huamán |
2019 |
Argentina |
Estudio descriptivo, transversal |
PCR Multiplex |
Identificación rápida y simultánea de varias cepas de E. coli en muestras de agua potable. |
(36) |
Moya, Sánchez, & Ruiz |
2019 |
China |
Estudio de cohorte |
PCR Digital |
Alta sensibilidad y precisión en la detección de Salmonella en productos alimenticios. |
(37) |
Sánchez , Escobar , & Delgado |
2020 |
India |
Estudio caso-control |
PCR en Tiemp o Real |
Detección rápida de Plasmodium falciparum en muestras de sangre, con una tasa de detección del 95%. |
(38) |
Campaña , Vallejo , & Munares |
2021 |
Colombia |
Revisión bibliográfica |
LAMP (Loop-mediated isothermal amplification) |
Detección eficiente y rápida de Mycobacterium tuberculosis con una alta especificidad. |
(39) |
Burboa , et al. 2021 |
2021 |
Canadá |
Estudio longitudinal |
RT-PCR |
Alta sensibilidad en la identificación de norovirus en muestras clínicas. |
(40) |
Melendez, Rueda, Garcia, & Maldonado |
2021 |
Corea del Sur |
Estudio de intervención comunitaria |
PCR en Tiempo Real |
Identificación precisa de cepas de Vibrio cholerae en muestras ambientales. |
(41) |
Bernalt |
2022 |
Irlanda |
Estudio experimental |
PCR de Toxinas |
Identificación rápida y precisa de cepas toxigénicas de Clostridium difficile. |
(42) |
Ochoa & Nohemy |
2023 |
Brasil |
Estudio descriptivo, transversal |
RT-qPCR |
Alta sensibilidad en la detección del virus Zika en muestras humanas. |
(43) |
Sante , Capón , Moreno , Coira , & Alonso |
2023 |
Japón |
Revisión sistemática |
PCR en Tiempo Real |
Detección rápida y precisa del virus de la hepatitis C en muestras de sangre. |
(44) |
Espinosa , Betancourt , & Betancourt |
2023 |
EE.UU. |
Estudio descriptivo, transversal |
PCR Digital |
Alta precisión en la detección de Legionella en sistemas de agua. |
(45) |
Mejía |
2023 |
España |
Estudio observacional |
qPCR |
Alta especificidad en la detección de Cryptosporidium en muestras de agua potable. |
(46) |
Diaz, 2023 |
2023 |
India |
Estudio de cohorte |
PCR en Tiempo Real |
Detección rápida y precisa de Leptospira en muestras de orina y sangre. |
(47) |
Correa , Paira, Gallo, Ortíz, & Paira |
2023 |
Egipto |
Estudio descriptivo, transversal |
PCR Multiplex |
Identificación rápida y simultánea de múltiples cepas de Helicobacter pylori en biopsias gástricas. |
(48) |
Análisis e interpretación
Las técnicas de biología molecular, como la PCR multiplex y la PCR digital, permiten la detección precisa y rápida de varios patógenos en diferentes matrices. La PCR en tiempo real y la RT-PCR ofrecen alta sensibilidad para identificar patógenos específicos, como el virus de la hepatitis C y Plasmodium falciparum. La especificidad excepcional de la qPCR se encuentra en muestras biológicas y ambientales como Cryptosporidium spp. y Leptospira spp. Estos avances mejoran el diagnóstico y la respuesta ante brotes de enfermedades infecciosas.
Tabla 3: Avances en Técnicas de Secuenciación Genética para el Diagnóstico de Enfermedades Infecciosas
Referencia |
Año |
País |
Metodología |
Técnica de Secuenciación |
Hallazgos |
Referencia |
Pazmiño, Vallejo , & Arguello |
2019 |
México |
Revisión Bibliográfica |
Secuenciación de Nueva Generación (NGS) |
Identificación de múltiples variantes de VPH en muestras clínicas, con una alta sensibilidad. |
(49) |
Fernández |
2019 |
China |
Revisión Bibliográfica |
Secuenciación de ARN |
Detección rápida de variantes del SARS-CoV-2 con una alta resolución genómica. |
(50) |
Mellado, |
2020 |
Canadá |
Revisión bibliográfica documental |
Secuenciación de Exoma Completo |
Detección precisa de variantes genéticas relacionadas con la enfermedad de Lyme en pacientes. |
(51) |
Zboromyrska |
2021 |
Corea del Sur |
Revisión Bibliográfica |
Secuenciación de Sanger |
Identificación de cepas de gripe A con una alta precisión y especificidad. |
(52) |
Smith, Doe, & Davis |
2022 |
EE.UU. |
Revisión bibliográfica |
Secuenciación de ARN |
Análisis detallado de la variabilidad genética del VIH en diferentes cohortes de pacientes. |
(53) |
Inca & Nieto |
2023 |
España |
Revisión Bibliográfica |
Secuenciación de Genoma Completo |
Identificación de variantes del virus de hepatitis B y su resistencia a tratamientos antivirales. |
(54) |
Ayala I. |
2023 |
Reino Unido |
Revisión Bibliográfica |
Secuenciación de Nueva Generación (NGS) |
Detección rápida y precisa de cepas de tuberculosis con resistencia a múltiples medicamentos. |
(55) |
Cardoza |
2023 |
Vietnam |
Revisión bibliográfica documental |
Secuenciación de Sanger |
Identificación de múltiples serotipos del virus del dengue en muestras clínicas. |
(56) |
Ramírez |
2023 |
Alemania |
Estudio analítico |
Secuenciación de Genoma Completo |
Alta precisión en la identificación de variantes del virus de la rabia en muestras de animales. |
(57) |
Ayala D. |
2023 |
Brasil |
prospectivo de cohorte |
Secuenciación de ARN |
Detección rápida y precisa de cepas de Chikungunya en pacientes infectados. |
(58) |
Hernandez |
2023 |
Pakistán |
Revisión Bibliográfica |
Secuenciación de Exoma Completo |
Identificación de variantes genéticas de Salmonella typhi en diferentes regiones geográficas. |
(59) |
Aller & Armesto |
2024 |
Egipto |
Estudio de diseño documental |
Secuenciación de Genoma Completo |
Detección de múltiples cepas de Plasmodium falciparum con resistencia a medicamentos antimaláricos. |
(60) |
Análisis e interpretación
Los avances en técnicas de secuenciación genética, como la secuenciación de nueva generación (NGS) y la secuenciación de genoma completo, han mejorado significativamente el diagnóstico de enfermedades infecciosas. Estas técnicas permiten detectar múltiples variantes y cepas específicas de patógenos como el VPH, tuberculosis resistente a medicamentos, y Plasmodium falciparum resistente a antimaláricos. Además, la secuenciación de ARN ha facilitado el análisis de la variabilidad genética en virus como el VIH y SARS-CoV-2.
Discusión
Fernández M., Moreno A., y García, J., compararon el diagnóstico microscópico y molecular para parasitosis intestinales, observando que la PCR detectó un 27% de positividad, significativamente superior al 9.5% del diagnóstico microscópico. Estos hallazgos subrayan la superioridad de las técnicas moleculares en la detección de parásitos, permitiendo una identificación más precisa de especies como B. hominis y Dientamoeba fragilis, que no siempre son evidentes con métodos tradicionales (Fernández, Moreno, & García, 2023).
Giuseppe, Angelina, Stefano, Sebastiana y Carmelo (2022) demostraron que la utilización de técnicas moleculares para detectar patógenos bacterianos de manera rápida mejora significativamente la precisión del diagnóstico y la gestión de las infecciones nosocomiales. Su estudio destacó la eficiencia de métodos como la PCR y los enfoques genómicos para identificar bacterias que son resistentes a múltiples medicamentos, como Staphylococcus aureus, Enterococcus faecium y Klebsiella pneumoniae. Estos avances son esenciales para el tratamiento temprano de brotes y la contención (62).
Yanfeng y Hongbin (2022) exploraron los beneficios de la secuenciación adaptativa de nanoporos basada en PCR para la detección viral. Este método mejora la sensibilidad y la rapidez en la identificación de patógenos virales, como el SARS-CoV-2, mejorando la vigilancia genómica y los diagnósticos clínicos (63).
Los resultados del presente estudio coinciden con los hallazgos antes mencionados, ya que la detección molecular de parasitosis en Ecuador permitió identificar una gran cantidad de patógenos, incluyendo parásitos que podrían pasar desapercibidos mediante métodos tradicionales. Esto resalta la eficacia y la ventaja de los métodos moleculares en la identificación de agentes patógenos en comparación con técnicas más antiguas.
En el estudio de Rahim, S, Chowdhury, S, & Ahmed, T, se evidenció una sensibilidad del 100% en la detección de Leishmania donovani en muestras de orina utilizando PCR en tiempo real, en comparación con las muestras de sangre y médula ósea. Esto destaca la capacidad de los métodos moleculares para proporcionar diagnósticos precisos y rápidos en enfermedades como la leishmaniasis visceral, optimizando así el proceso diagnóstico (64).
Ziqin Lin (2022) discutió el impacto revolucionario de la mNGS en el diagnóstico de enfermedades infecciosas complejas y raras. La técnica permite la detección integral sin necesidad de cultivo, siendo altamente efectiva para patógenos como bacterias, hongos, virus y parásitos. Este método es particularmente útil para identificar patógenos raros o nuevos que los métodos tradicionales podrían no detectar (65).
Además, estos estudios muestran que las técnicas moleculares como la PCR y la secuenciación genética ofrecen una alta sensibilidad para detectar una variedad de enfermedades infecciosas. Estas técnicas han mejorado significativamente la precisión diagnóstica y permiten una respuesta más rápida y efectiva a enfermedades como la leishmaniasis.
De la Rica, A., López, M., & Fernández, P, validaron el sistema molecular AMR Direct Flow Chip® para detectar genes de resistencia antimicrobiana, mostrando una sensibilidad y especificidad del 100% en muestras rectales y del 97% en hisopos nasales. Este estudio demuestra el impacto significativo de las técnicas moleculares en la identificación de resistencia antimicrobiana, lo cual es crucial para la gestión de infecciones y el tratamiento adecuado (66).
Eva Dueñas (2022) desarrollo un biosensor de flujo lateral basado en nanopartículas integrado con amplificación isotérmica mediada por bucle (LAMP) para la identificación rápida y visual de Chlamydia trachomatis. Esta herramienta de diagnóstico en el punto de atención ofrece alta sensibilidad y especificidad, facilitando el diagnóstico y tratamiento rápido en entornos clínicos (67).
La investigación actual respalda los hallazgos de De la Rica-Martínez et al. (2022) al evidenciar que técnicas como la PCR y la secuenciación genética no solo optimizan la detección de patógenos, sino que también permiten el análisis de genes de resistencia antimicrobiana. Este avance es fundamental para enfrentar la resistencia a los antibióticos y mejorar las estrategias de tratamiento en infecciones bacterianas y parasitarias.
Conclusión
Las técnicas de biología molecular, como la PCR y la secuenciación genética, han mostrado avances notables en la precisión y rapidez del diagnóstico de enfermedades infecciosas. Estas metodologías superan a los métodos tradicionales en términos de sensibilidad y especificidad, permitiendo una detección más temprana y fiable de patógenos.
Las técnicas moleculares han mejorado significativamente el diagnóstico de enfermedades infecciosas al detectar y distinguir patógenos, incluso en concentraciones bajas. Las técnicas como estas permiten la detección de variantes genéticas y cepas particulares que normalmente no se pueden encontrar mediante métodos convencionales.
Las técnicas moleculares han mejorado la práctica clínica y la salud pública. El uso de PCR en tiempo real y secuenciación genética ha sido posible en Ecuador para monitorear enfermedades como la tuberculosis y la parasitosis de manera más efectiva, lo que ha optimizado la gestión y control de estas enfermedades.
La continua evolución de la biología molecular abre nuevas perspectivas para la investigación y el desarrollo de métodos de diagnóstico más atractivos. Estos avances se espera que sigan mejorando la comprensión de las enfermedades infecciosas y las técnicas de prevención y tratamiento.
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