La presente investigación tuvo como objetivo determinar la calidad del agua del río Warintz en el tramo Yawi - Warintza mediante la aplicación del índice Biological Monitoring Working Party Colombia (BMWP/Col) y el índice de calidad del agua (ICA) propuesta por la Nacional Sanitation Foundation (NSF). Se inició con la selección de 4 estaciones de monitoreo denominadas PW-1, PW-2, PW-3 y PW-4, llevadas a cabo mensualmente en los meses de diciembre de 2021, enero y febrero de 2022. Se analizaron 8 parámetros fisicoquímicos y 1 microbiológico, parámetros como temperatura, pH y oxígeno disuelto se midieron in situ mientras que, la DBO5, SDT, OD, nitratos, fosfatos, coliformes fecales se analizaron en laboratorio siguiendo la metodología desarrollada por el Standar Methods. Para la colecta de macroinvertebrados se utilizó la red D-net ya que el método requerido es cualitativo, posterior las muestras fueron llevadas al laboratorio para su reconocimiento taxonómico. Los resultados obtenidos según el índice ICA-NSF en las estaciones PW-1, PW-2, PW-3 y PW-4 presenta una calidad de agua MEDIA, mientras que, con el índice BMWP/Col en las cuatro estaciones de monitoreo presenta una calidad de agua ACEPTABLE con clase II con aguas ligeramente contaminadas y se registró un total de 10 órdenes pertenecientes a 23 familias en las tres campañas de monitoreo. Según el análisis canónico de correspondencia (ACC) muestran cuatro agrupaciones donde relacionan ciertos parámetros fisicoquímicas y familias de macroinvertebrados. En conclusión, la calidad del agua de río Warintza disminuye conforme se acerca al casco urbano y en épocas lluviosas, por lo que se recomienda implementar un plan de manejo para la conservación y recuperación de esta fuente hídrica.